公元2035年,人类被12只猴子军研制的一种病䓯侵袭,大部分人类都在这场病陈源没有时间考虑,因为申屠信吼出来的金色光圈抵消了陈源的次元刀之后,就四蹄再次飞扬,一扑就凌空扑到陈源前方的上空,眼看四蹄落地之前就能咬到陈源的脖子。䓯灾难中死亡,只有少数人侥幸逃生,但也只能在阴暗的地下,苟且鍮生。
科学家们决定派人穿越时光回到1996年追查12只猴子军的来历。囚徒詹姆斯·科尔(布鲁斯·威利斯 Bruce Willis 饰)被 挑选为志愿者。阴差阳错,科尔回到了1990年,当他向当时的人们描述未来的那场大灾难时,被当作精神病捉了起来并被医生凯瑟琳·雪莉(玛德琳·斯通 Madeleine Stowe 饰)诊断为精神分裂症。科尔在病友杰弗里·戈因斯帮助下逃脫,回到了未来。因为没查清12只猴子军的来历,科尔再次被派回了1996年。
科尔这次发现了12只猴子军的起源地在费城,他找到了医生凯瑟琳,二人一起展开了追查12只猴子军的冒险之旅!